工業(yè)生物過程大數(shù)據(jù)縱向組學(xué)研究
研究方向:本室在13C代謝流和全基因組網(wǎng)絡(luò)模型的基礎(chǔ)上提出了縱向組學(xué)的研究思路,以期建立基因型和環(huán)境型對細胞生理表型的調(diào)控關(guān)系。
研究方法:以全基因組代謝網(wǎng)絡(luò)模型(GSMM)整合不同組學(xué)數(shù)據(jù)(基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組和代謝物組),結(jié)合實測胞內(nèi)13C代謝流數(shù)據(jù)驗證全基因組網(wǎng)絡(luò)模型的預(yù)測結(jié)果。通過縱向組學(xué)數(shù)據(jù)的整合發(fā)現(xiàn)產(chǎn)物合成的代謝瓶頸,從而實現(xiàn)工業(yè)生產(chǎn)菌株的理性設(shè)計和發(fā)酵過程的全局優(yōu)化。
不同組學(xué)研究方法
縱向組學(xué)在工業(yè)生物過程中的應(yīng)用
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